Dostawa systemu sekwencjonowania DNA/RNA drobnoustrojów w technologii długich odczytów

Przedmiotem planowanego zamówienia jest dostawa, instalacja oraz uruchomienie zintegrowanego systemu sekwencjonowania kwasów nukleinowych, przeznaczonego do realizacji zaawansowanych analiz genomowych, metagenomicznych oraz transkryptomicznych, wraz z dedykowanym oprogramowaniem, materiałami startowymi, stacją roboczą, szkoleniem personelu oraz gwarancją producenta. System umożliwia sekwencjonowanie długich fragmentów DNA i RNA z wysoką wydajnością, prowadzenie równoległych eksperymentów sekwencjonowania oraz generowanie danych w czasie rzeczywistym. Rozwiązanie obejmuje w pełni zintegrowany moduł obliczeniowy klasy laboratoryjnej, umożliwiający lokalne przetwarzanie danych, w tym automatyczną konwersję sygnału pierwotnego do postaci sekwencji nukleotydowych oraz wstępną analizę jakościową wyników, bez konieczności korzystania z zewnętrznej infrastruktury informatycznej.

1. Sekwencjonowanie realizowane na urządzeniu opiera się na bezpośrednim, elektronicznym odczycie sekwencji kwasów nukleinowych na pojedynczej cząsteczce, bez etapu amplifikacji klonalnej. Proces polega na pomiarze zmian sygnału elektrycznego generowanego przez przechodzącą przez nanostrukturalny kanał cząsteczkę DNA lub RNA.

2. Urządzenie fabrycznie nowe, nierekondycjonowane, nieregenerowane, 3. Możliwość jednoczesnego prowadzenia 2 niezależnych eksperymentów sekwencjonowania na osobnych portach.

4. Zdolność generowania do 290 Gb danych z jednej (flow cell) w ciągu 72 godzin.

5. Możliwość sekwencjonowania DNA ligowanego, PCR, c DNA, RNA, sekwencjonowania długich fragmentów, bibliotek NGS oraz kodowania wielu próbek (barcoding).

6. Zainstalowane oprogramowanie do zarządzania sekwencjonowaniem i analizy danych dedykowane dla proponowanego urządzenia.

7. Wymiary urządzenia nie przekraczają 180 mm x 225 mm x 430 mm [+/- 10%].

8. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 24 miesięcy.

Przedmiotem planowanego zamówienia jest dostawa, instalacja oraz uruchomienie zintegrowanego systemu sekwencjonowania kwasów nukleinowych, przeznaczonego do realizacji zaawansowanych analiz genomowych, metagenomicznych oraz transkryptomicznych, wraz z dedykowanym oprogramowaniem, materiałami startowymi, stacją roboczą, szkoleniem personelu oraz gwarancją producenta. System umożliwia sekwencjonowanie długich fragmentów DNA i RNA z wysoką wydajnością, prowadzenie równoległych eksperymentów sekwencjonowania oraz generowanie danych w czasie rzeczywistym. Rozwiązanie obejmuje w pełni zintegrowany moduł obliczeniowy klasy laboratoryjnej, umożliwiający lokalne przetwarzanie danych, w tym automatyczną konwersję sygnału pierwotnego do postaci sekwencji nukleotydowych oraz wstępną analizę jakościową wyników, bez konieczności korzystania z zewnętrznej infrastruktury informatycznej.

1. Sekwencjonowanie realizowane na urządzeniu opiera się na bezpośrednim, elektronicznym odczycie sekwencji kwasów nukleinowych na pojedynczej cząsteczce, bez etapu amplifikacji klonalnej. Proces polega na pomiarze zmian sygnału elektrycznego generowanego przez przechodzącą przez nanostrukturalny kanał cząsteczkę DNA lub RNA.

2. Urządzenie fabrycznie nowe, nierekondycjonowane, nieregenerowane, 3. Możliwość jednoczesnego prowadzenia 2 niezależnych eksperymentów sekwencjonowania na osobnych portach.

4. Zdolność generowania do 290 Gb danych z jednej (flow cell) w ciągu 72 godzin.

5. Możliwość sekwencjonowania DNA ligowanego, PCR, c DNA, RNA, sekwencjonowania długich fragmentów, bibliotek NGS oraz kodowania wielu próbek (barcoding).

6. Zainstalowane oprogramowanie do zarządzania sekwencjonowaniem i analizy danych dedykowane dla proponowanego urządzenia.

7. Wymiary urządzenia nie przekraczają 180 mm x 225 mm x 430 mm [+/- 10%].

8. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 24 miesięcy.

1. Środki ochrony prawnej przysługują wykonawcy, uczestnikowi konkursu oraz innemu podmiotowi, jeżeli ma lub miał interes w uzyskaniu zamówienia oraz poniósł lub może ponieść szkodę w wyniku naruszenia przez zamawiającego przepisów ustawy PZP.

2. Środki ochrony prawnej wobec ogłoszenia wszczynającego postępowanie o udzielenie zamówienia oraz dokumentów zamówienia przysługują również organizacjom wpisanym na listę, o której mowa w art. 469 pkt. 15 PZP oraz Rzecznikowi Małych i Średnich Przedsiębiorców.

3. Odwołanie przysługuje na:

1) niezgodną z przepisami ustawy czynność Zamawiającego, podjętą w postępowaniu o udzielenie zamówienia, w tym na projektowane postanowienie umowy;

2) zaniechanie czynności w postępowaniu o udzielenie zamówienia do której zamawiający był obowiązany na podstawie ustawy;

4. Odwołanie wnosi się do Prezesa Izby. Odwołujący przekazuje kopię odwołania zamawiającemu przed upływem terminu do wniesienia odwołania w taki sposób, aby mógł on zapoznać się z jego treścią przed upływem tego terminu.

5. Odwołanie wobec treści ogłoszenia lub treści SWZ wnosi się w terminie 10 dni od dnia zamieszczenia ogłoszenia w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej lub zamieszczenia dokumentów na stronie internetowej.

6. Odwołanie wnosi się w terminie:

1) 10 dni od dnia przekazania informacji o czynności zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana przy użyciu środków komunikacji elektronicznej,

2) 15 dni od dnia przekazania informacji o czynności zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana w sposób inny niż określony w pkt 1).

7. Odwołanie w przypadkach innych niż określone w pkt 23.5 i 23.6 wnosi się w terminie 10 dni od dnia, w którym powzięto lub przy zachowaniu należytej staranności można było powziąć wiadomość o okolicznościach stanowiących podstawę jego wniesienia.

8. Na orzeczenie Izby oraz postanowienie Prezesa Izby, o którym mowa w art. 519 ust. 1 PZP, stronom oraz uczestnikom postępowania odwoławczego przysługuje skarga do sądu.

9. W postępowaniu toczącym się wskutek wniesienia skargi stosuje się odpowiednio przepisy ustawy z dnia 17 listopada 1964 r. - Kodeks postępowania cywilnego o apelacji, jeżeli przepisy niniejszego rozdziału nie stanowią inaczej.

10. Skargę wnosi się do Sądu Okręgowego w Warszawie - sądu zamówień publicznych, zwanego dalej "sądem zamówień publicznych".

11. Skargę wnosi się za pośrednictwem Prezesa Izby, w terminie 14 dni od dnia doręczenia orzeczenia Izby lub postanowienia Prezesa Izby, o którym mowa w art. 519 ust. 1 ustawy PZP, przesyłając jednocześnie jej odpis przeciwnikowi skargi. Złożenie skargi w placówce pocztowej operatora wyznaczonego w rozumieniu ustawy z dnia 23 listopada 2012 r. - Prawo pocztowe jest równoznaczne z jej wniesieniem.

12. Prezes Izby przekazuje skargę wraz z aktami postępowania odwoławczego do sądu zamówień publicznych w terminie 7 dni od dnia jej otrzymania.

13. Od wyroku sądu zamówień publicznych lub postanowienia kończącego postępowanie w sprawie przysługuje skarga kasacyjna do Sądu Najwyższego.