Dostawa systemu do identyfikacji genetycznej drobnoustrojów wraz z urządzeniem do frakcjonowania próbek DNA

Przedmiotem planowanego zamówienia jest dostawa, instalacja oraz uruchomienie dwóch komplementarnych urządzeń laboratoryjnych przeznaczonych do realizacji analiz z zakresu genomiki, transkryptomiki, mikrobiologii oraz proteomiki, wraz z niezbędnym oprogramowaniem, materiałami startowymi, szkoleniem użytkowników oraz gwarancją producenta. Dostawca zapewni oba urządzenia w ramach jednego zamówienia, wraz z ich pełną kompatybilnością aplikacyjną do analizy metagenomicznej mikroorganizmów Urządzenie nr 1: Sekwenator nowej generacji (NGS) wykorzystujący technologię krótkich odczytów.

1. Sekwencjonowanie przez syntezę (SBS) z dwukanałową detekcją sygnału fluorescencyjnego lub równoważną.

2. Obsługa sekwencjonowania w trybie pojedynczych oraz sparowanych odczytów (paired‑end).

3. Pełna automatyzacja kluczowych etapów procesu tj. (i) amplifikacja klonalna na pokładzie urządzenia, (ii) denaturacja bibliotek), (iii) sekwencjonowanie, (iv) analiza danych drugorzędowych.

4. Brak konieczności stosowania emulsyjnego PCR oraz dodatkowych zewnętrznych urządzeń.

5. Zakres długości odczytu: co najmniej od 1 × 100 pz do 2 × 300 pz lub więcej.

6. Maksymalna wydajność pojedynczego cyklu sekwencjonowania to ok. 30 Gb danych.

7. Maksymalna liczba odczytów generowanych w jednym cyklu pracy to ok. 200 mln w trybie paired-end.

8. Dokładność odczytu na poziomie Q30 ≥ 85% dla sekwencjonowania 2 x 300 pz.

9. Zintegrowany, dotykowy interfejs użytkownika (ekran o rozdzielczości 1920 x 1080 full HD) umożliwiający pełne sterowanie aparatem bez dodatkowej stacji roboczej.

10. Urządzenie z przeznaczeniem do sekwencjonowania małych genomów mikroorganizmów, detekcji panelowej patogenów, metagenomika 16 S r RNA oraz typu shotgun.

11. Wymiary urządzenia nie powinny przekraczać 41 x 45 x 48 cm.

12. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 36 miesięcy wraz z jednym przeglądem w okresie gwarancji. Urządzenie nr 2: Frakcjonator kwasów nukleinowych (DNA/RNA) i białek 1. Urządzenie do elektroforezy preparatywnej umożliwiające rozdział pojedynczej próbki DNA na co najmniej 12 frakcji, zbieranych w postaci ciekłej;

2. Zakres rozdziału: (i) DNA o długości od 100 pz do 40 kpz, (ii) białka o masie cząsteczkowej od 10 k Da do 500 k Da.

3. Rozdział następuje w dedykowanych kasetach przeznaczonych do frakcjonowania pojedynczej próbki.

4. Możliwość równoczesnego prowadzenia elektroforezy preparatywnej w co najmniej dwóch kasetach żelowych.

5. Standardowy czas pojedynczego frakcjonowania nie przekracza 3 godzin.

6. W ramach zamówienia Wykonawca zapewni po jednym opakowaniu kompatybilnych materiałów zużywalnych tj. 10 szt. kaset do frakcjonowania DNA (~2% agarozowy żel) wraz z markerem wielkości oraz 10 szt. kaset do frakcjonowania białek w zakresie 10-300 k Da.

7. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 48 miesięcy wraz z jednym przeglądem w okresie gwarancji

Przedmiotem planowanego zamówienia jest dostawa, instalacja oraz uruchomienie dwóch komplementarnych urządzeń laboratoryjnych przeznaczonych do realizacji analiz z zakresu genomiki, transkryptomiki, mikrobiologii oraz proteomiki, wraz z niezbędnym oprogramowaniem, materiałami startowymi, szkoleniem użytkowników oraz gwarancją producenta. Dostawca zapewni oba urządzenia w ramach jednego zamówienia, wraz z ich pełną kompatybilnością aplikacyjną do analizy metagenomicznej mikroorganizmów Urządzenie nr 1: Sekwenator nowej generacji (NGS) wykorzystujący technologię krótkich odczytów 1. Sekwencjonowanie przez syntezę (SBS) z dwukanałową detekcją sygnału fluorescencyjnego lub równoważną.

2. Obsługa sekwencjonowania w trybie pojedynczych oraz sparowanych odczytów (paired‑end).

3. Pełna automatyzacja kluczowych etapów procesu tj. (i) amplifikacja klonalna na pokładzie urządzenia, (ii) denaturacja bibliotek), (iii) sekwencjonowanie, (iv) analiza danych drugorzędowych.

4. Brak konieczności stosowania emulsyjnego PCR oraz dodatkowych zewnętrznych urządzeń.

5. Zakres długości odczytu: co najmniej od 1 × 100 pz do 2 × 300 pz lub więcej.

6. Maksymalna wydajność pojedynczego cyklu sekwencjonowania to ok. 30 Gb danych.

7. Maksymalna liczba odczytów generowanych w jednym cyklu pracy to ok. 200 mln w trybie paired-end.

8. Dokładność odczytu na poziomie Q30 ≥ 85% dla sekwencjonowania 2 x 300 pz.

9. Zintegrowany, dotykowy interfejs użytkownika (ekran o rozdzielczości 1920 x 1080 full HD) umożliwiający pełne sterowanie aparatem bez dodatkowej stacji roboczej.

10. Urządzenie z przeznaczeniem do sekwencjonowania małych genomów mikroorganizmów, detekcji panelowej patogenów, metagenomika 16 S r RNA oraz typu shotgun.

11. Wymiary urządzenia nie powinny przekraczać 41 x 45 x 48 cm.

12. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 36 miesięcy wraz z jednym przeglądem w okresie gwarancji. Urządzenie nr 2: Frakcjonator kwasów nukleinowych (DNA/RNA) i białek 1. Urządzenie do elektroforezy preparatywnej umożliwiające rozdział pojedynczej próbki DNA na co najmniej 12 frakcji, zbieranych w postaci ciekłej;

2. Zakres rozdziału: (i) DNA o długości od 100 pz do 40 kpz, (ii) białka o masie cząsteczkowej od 10 k Da do 500 k Da.

3. Rozdział następuje w dedykowanych kasetach przeznaczonych do frakcjonowania pojedynczej próbki.

4. Możliwość równoczesnego prowadzenia elektroforezy preparatywnej w co najmniej dwóch kasetach żelowych.

5. Standardowy czas pojedynczego frakcjonowania nie przekracza 3 godzin.

6. W ramach zamówienia Wykonawca zapewni po jednym opakowaniu kompatybilnych materiałów zużywalnych tj. 10 szt. kaset do frakcjonowania DNA (~2% agarozowy żel) wraz z markerem wielkości oraz 10 szt. kaset do frakcjonowania białek w zakresie 10-300 k Da.

7. Urządzenie wraz z gwarancją na okres min. 48 miesięcy wraz z jednym przeglądem w okresie gwarancji.

1. Środki ochrony prawnej przysługują wykonawcy, uczestnikowi konkursu oraz innemu podmiotowi, jeżeli ma lub miał interes w uzyskaniu zamówienia oraz poniósł lub może ponieść szkodę w wyniku naruszenia przez zamawiającego przepisów ustawy PZP.

2. Środki ochrony prawnej wobec ogłoszenia wszczynającego postępowanie o udzielenie zamówienia oraz dokumentów zamówienia przysługują również organizacjom wpisanym na listę, o której mowa w art. 469 pkt. 15 PZP oraz Rzecznikowi Małych i Średnich Przedsiębiorców.

3. Odwołanie przysługuje na:

1) niezgodną z przepisami ustawy czynność Zamawiającego, podjętą w postępowaniu o udzielenie zamówienia, w tym na projektowane postanowienie umowy;

2) zaniechanie czynności w postępowaniu o udzielenie zamówienia do której zamawiający był obowiązany na podstawie ustawy;

4. Odwołanie wnosi się do Prezesa Izby. Odwołujący przekazuje kopię odwołania zamawiającemu przed upływem terminu do wniesienia odwołania w taki sposób, aby mógł on zapoznać się z jego treścią przed upływem tego terminu.

5. Odwołanie wobec treści ogłoszenia lub treści SWZ wnosi się w terminie 10 dni od dnia zamieszczenia ogłoszenia w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej lub zamieszczenia dokumentów na stronie internetowej.

6. Odwołanie wnosi się w terminie:

1) 10 dni od dnia przekazania informacji o czynności zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana przy użyciu środków komunikacji elektronicznej,

2) 15 dni od dnia przekazania informacji o czynności zamawiającego stanowiącej podstawę jego wniesienia, jeżeli informacja została przekazana w sposób inny niż określony w pkt 1).

7. Odwołanie w przypadkach innych niż określone w pkt 23.5 i 23.6 wnosi się w terminie 10 dni od dnia, w którym powzięto lub przy zachowaniu należytej staranności można było powziąć wiadomość o okolicznościach stanowiących podstawę jego wniesienia.

8. Na orzeczenie Izby oraz postanowienie Prezesa Izby, o którym mowa w art. 519 ust. 1 PZP, stronom oraz uczestnikom postępowania odwoławczego przysługuje skarga do sądu.

9. W postępowaniu toczącym się wskutek wniesienia skargi stosuje się odpowiednio przepisy ustawy z dnia 17 listopada 1964 r. - Kodeks postępowania cywilnego o apelacji, jeżeli przepisy niniejszego rozdziału nie stanowią inaczej.

10. Skargę wnosi się do Sądu Okręgowego w Warszawie - sądu zamówień publicznych, zwanego dalej "sądem zamówień publicznych".

11. Skargę wnosi się za pośrednictwem Prezesa Izby, w terminie 14 dni od dnia doręczenia orzeczenia Izby lub postanowienia Prezesa Izby, o którym mowa w art. 519 ust. 1 ustawy PZP, przesyłając jednocześnie jej odpis przeciwnikowi skargi. Złożenie skargi w placówce pocztowej operatora wyznaczonego w rozumieniu ustawy z dnia 23 listopada 2012 r. - Prawo pocztowe jest równoznaczne z jej wniesieniem.

12. Prezes Izby przekazuje skargę wraz z aktami postępowania odwoławczego do sądu zamówień publicznych w terminie 7 dni od dnia jej otrzymania.

13. Od wyroku sądu zamówień publicznych lub postanowienia kończącego postępowanie w sprawie przysługuje skarga kasacyjna do Sądu Najwyższego.