Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)

1. Przedmiotem niniejszego zamówienia jest usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing).

2. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach).

3. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

4. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:

• całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore)

• stężenie w próbce >100 ng/ul

• czystość (A260/A280) ≥

1.8

5. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się:

• sprawdzenie jakości próbek DNA dostarczonych przez Zamawiającego

• sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x)

• sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA

• wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym.

• w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA, poprzez kontakt mailowy

6. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera SWZ oraz Opis przedmiotu zamówienia - Załącznik nr1, Projektowane postanowienia umowy - Załącznik nr 2, Formularz cenowy - Załącznik nr 5.

7. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert częściowych.

8. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert wariantowych.

9. Zamawiający nie przewiduje skorzystania z prawa opcji.

10. Zamawiający nie przewiduje zawarcia umowy ramowej.