Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)

1. Przedmiotem niniejszego zamówienia jest usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing).

2. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach).

3. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

4. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:

• całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore)

• stężenie w próbce >100 ng/ul

• czystość (A260/A280) ≥ 1.8 5. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się:

• sprawdzenie jakości próbek DNA dostarczonych przez Zamawiającego

• sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x)

• sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA

• wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym.

• w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA, poprzez kontakt mailowy 6. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera SWZ oraz Opis przedmiotu zamówienia - Załącznik nr1, Projektowane postanowienia umowy - Załącznik nr 2, Formularz cenowy - Załącznik nr 5.

7. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert częściowych.

8. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert wariantowych.

9. Zamawiający nie przewiduje skorzystania z prawa opcji.

10. Zamawiający nie przewiduje zawarcia umowy ramowej.

1. W prowadzonym postępowaniu, w oparciu o art. 139 ust. 1 ustawy Pzp, Zamawiający najpierw dokona badania i oceny ofert, a następnie dokona kwalifikacji podmiotowej Wykonawcy, którego oferta została najwyżej oceniona, w zakresie braku podstaw wykluczenia oraz spełniania warunków udziału w postępowaniu.

2. Zamawiający wykluczy z postępowania wykonawców, wobec których zachodzą podstawy wykluczenia, o których mowa w art. 108 ust. 1 z zastrzeżeniem art 110 ust. 2 ustawy Pzp.

3. Zamawiający wykluczy Wykonawców, wobec których zachodzą podstawy wykluczenia, o których mowa w art. 7 ust. 1 ustawy z dnia 13 kwietnia 2022 r. o szczególnych rozwiązaniach w zakresie przeciwdziałania wspieraniu agresji na Ukrainę oraz służących ochronie bezpieczeństwa narodowego (t.j. Dz. U. z 2024 r. poz. 507) oraz w art. 5k rozporządzenia Rady (UE) 833/2014 z dnia 31 lipca 2014 r. dotyczącego środków ograniczających w związku z działaniami Rosji destabilizującymi sytuację na Ukrainie (Dz. Urz. UE. L Nr 229, str. 1 z późniejszymi zmianami) - wzór oświadczenia stanowi Załącznik nr 9 do SWZ.

4. Wykonawca zobowiązany jest złożyć ofertę zgodnie z Formularzem ofertowym, stanowiącym Załącznik nr 3 do SWZ i Formularzem cenowym, stanowiącym załącznik nr 5 do SWZ.

5. Wraz z ofertą Wykonawca zobowiązany jest złożyć oświadczenie, o którym mowa w art. 125 ust. 1 ustawy Pzp (JEDZ/ESPD), którego wzór stanowi załącznik nr 4 do SWZ, w zakresie wskazanym w SWZ. Wykonawca składa oświadczenie na formularzu JEDZ. JEDZ stanowi dowód potwierdzający brak podstaw wykluczenia oraz spełnianie warunków udziału w postępowaniu, na dzień składania ofert oraz stanowi dowód tymczasowo zastępujący wymagane przez zamawiającego podmiotowe środki dowodowe, wskazane w SWZ. Serwis umożliwiający wypełnienie i ponowne wykorzystanie „jednolitego dokumentu” dostępny jest pod adresem: https://espd.uzp.gov.pl.

6. Wykaz podmiotowych środków dowodowych na potwierdzenie spełniania warunków udziału w postępowaniu oraz braku podstaw wykluczenia określony został w Rozdziale VIII SWZ.

7. Zamawiający, stosownie do art. 95 ust. 1 ustawy Pzp wymaga zatrudnienia przez Wykonawcę lub podwykonawcę na podstawie stosunku pracy osób wykonujących czynności w zakresie realizacji zamówienia, których wykonanie polega na wykonywaniu pracy w sposób określony w art. 22 § 1 ustawy z dnia 26 czerwca 1974 r. - Kodeks pracy (t.j. Dz. U. z 2023 r. poz. 1465 ze zm.). Zamawiający wymaga zatrudnienia na umowę o pracę osób bezpośrednio wykonujących czynności związane z usługą sekwencjonowania.

8. Zamawiający nie wymaga zatrudnienia osób, o których mowa w art. 96 ust. 2 pkt 2 ustawy Pzp.

9. Zamawiający nie wymaga złożenia przedmiotowych środków dowodowych.

10. Zamawiający nie wymaga wniesienia wadium.

11. Postępowanie prowadzone jest w języku polskim.

12. Wykonawca powinien zapoznać się ze specyfikacją warunków zamówienia, zwaną dalej „SWZ”.

13. Komunikacja zamawiającego z wykonawcami odbywa się przy użyciu środków komunikacji elektronicznej, przy użyciu platformy zakupowej „e Zamawiający” firmy Otwarty Rynek Elektroniczny S. A. – Marketplanet, ul. Domaniewska 49, 02-672 Warszawa, zwanej dalej „Platformą”, dostępną pod adresem: https://nil.ezamawiajacy.pl.

14. We wszelkiej korespondencji związanej z niniejszym postępowaniem zamawiający i wykonawcy posługują się nr sprawy 20/NIL/ZZ-SP/24 15. Szczegółowa instrukcja korzystania z Platformy dostępna jest pod ww. adresem https://nil.ezamawiajacy.pl w zakładce „Baza Wiedzy”. Problemy w obsłudze Platformy należy zgłaszać na adres: ezamawiajacy_zgloszenia@marketplanet.pl lub pod nr tel. + 48 22 257 22 23.

1. Przedmiotem zamówienia jest usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing).

2. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi wielorazowej (w transzach).

3. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

4. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA:

• całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore)

• stężenie w próbce >100 ng/ul

• czystość (A260/A280) ≥ 1.8.

5. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się:

• sprawdzenie jakości próbek DNA dostarczonych przez Zamawiającego

• sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x)

• sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA

• wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym.

• w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA, poprzez kontakt mailowy. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera SWZ oraz Załącznik nr 1 (Opis przedmiotu zamówienia), Załącznik nr 2 (Projektowane postanowienia umowy), Załącznik nr 5 (Formularz cenowy)