Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)

1. Zamawiający zleca Wykonawcy wykonanie usługi sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing) wielorazowej (w transzach).

2. Wykonanie usługi sekwencjonowania dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek

3. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego.

Parametry DNA:

• całkowita ilość ≥ 500ng- (1,5ug Nanopore)

• stężenie w próbce >5 ng/ul (70ng/ul Nanopore)

• czystość (A260/A280) ≥

1.8

Parametry RNA:

• całkowita ilość ≥ 2 ug

• stężenie w próbce >40 ng/ul

• czystość (A260/A280) ≥

1.8

4. Za prawidłowe wykonanie usługi uważa się:

• sprawdzenie jakości próbek DNA i RNA dostarczonych przez Zamawiającego

• sekwencjonowanie nowej generacji NGS przygotowanych preparatów prób bakteryjnego DNA z zapewnieniem wymaganej ilości odczytów (pokrycie min. 50x)

• sekwencjonowanie trzeciej generacji NGS przygotowanych preparatów dla wybranych prób bakteryjnego DNA

• wykonanie analizy bioinformatycznej i przekazanie danych Zamawiającemu wraz z raportem końcowym.

• w trakcie wykonywania usługi bieżące informowanie Zamawiającego o postępach prac nad zleconymi próbkami i ew. problemach, np. w zakresie jakości przesłanych próbek DNA i RNA, poprzez kontakt mailowy.

Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia został określony w SWZ - Opis przedmiotu zamówienia - Załącznik nr 1.

5. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert częściowych.

6. Zamawiający nie dopuszcza składania ofert wariantowych.

7. Zamawiający nie przewiduje skorzystania z prawa opcji.